Mots-clés :

Mathématiques discrètes et combinatoire, réseaux d'interactions, théorie des graphes, systèmes dynamiques finis

Thèmes de recherche :

Mes débuts dans la recherche, au sein d'une équipe animée par Gérard Rauzy, avec une forte tradition de théorie des nombres, ont été consacrés à des travaux liant théorie ergodique et suites arithmétiques, à travers des systèmes dynamiques associés. Ces travaux m'ont confrontée à des problèmes de mots, de langage, poussant vers la combinatoire des mots, et plus généralement la combinatoire. L'ère du "tout génome" arrivant, une collaboration avec des généticiens nous a amenés à chercher des outils de mathématiques discrètes pour l'étude des séquences génétiques.
En 2000, Denis Thieffry, spécialiste des réseaux d'interactions de gènes arrivant à Marseille, m'a orientée vers ce sujet, qui utilise des outils combinatoires, théorie des graphes beaucoup, pour l'étude des systèmes dynamiques finis associés. C'est la thématique à laquelle je me consacre maintenant dans MABioS, où l'interface toujours renforcée avec biologistes et médecins pousse en amont à développer encore des outils mathématiques pour l'étude de ces réseaux.

Publications

  • Jean Fabre-Monplaisir, Brigitte Mossé, and Elisabeth REMY. Isometries of the hypercube: a tool for boolean regulatory networks analysis  . Physica D: Nonlinear Phenomena, 2021.

  • B. Mossé and É. Remy. A Combinatorial Exploration of Boolean Dynamics Generated by Isolated and Chorded Circuits. Acta Biotheoretica, 2019.

  • É. Remy, B. Mossé, and D. Thieffry. Boolean dynamics of regulatory compound circuits. In Dynamics of mathematical models in Biology, 43:53, 2016.

  • C. Chaouiya, É. Remy, B. Mossé, and D. Thieffry: Qualitative analysis of regulatory graphs: a computational tool based on a discrete formal framework. In "First multidisciplinary international symposium on POsitive Systems: Theory and Applications" (POSTA 2003), L. Benvenuti, A. De Santis, L. Farina (Eds), Springer-Verlag, LNCIS 294, pp. 119-126, 2003.

  • É. Remy, B. Mossé, C. Chaouiya and D. Thieffry: A description of dynamical graphs associated to elementary regulatory circuits. Bioinformatics vol.19 (Suppl. 2), pp.172--178, 2003.

  • G. Didier, P. Durosay, B. Mossé, Y. d'Aubenton-Carafa, C. Thermes, Detection of RNA structures by two dimension analysis of sequences, Computers and Chemistry, 2003.

  • S. Jaeger, R. Lima, B. Mossé, Symbolic analysis of finite words : The complexity function, Bull. Braz. Math. Soc., New Series, 34 (3) (2003), 457-477.

  • B. Mossé, Reconnaissabilité des substitutions et complexité des suites automatiques, Bull. SMF 124 (1996), 329-346.

  • E. Lesigne, C. Mauduit, B. Mossé, Le théorème ergodique le long des suites q- multiplicatives, Compositio Mathematica 93 (1994), 49-79.

  • B. Mossé, Puissances de mots et reconnaissabilité des points fixes de substitutions, Theoretical Computer Science 99 (1992), 327-334.

  • C. Mauduit, B. Mossé, Suites de Gq-orbite finie, Acta Arithmetica 57 (1991), 69-82.

  • B. Mossé, q-adic spectral analysis of some arithmetic sequences, Theoretical Computer Science 65 (1989), 249-263.

  • C. Mauduit, B. Mossé, Etude spectrale de la multiplication q-adique, Compositio Mathematica 67 (1988), 129-147.